Проблема точно в различии имени владельца объекта существующего на SQL-server и того, который импортируется.
Вообще, owner'ом всех объектов на SQL-сервере должен быть dbo. Уж не помню где, но читал об этом. Остальным пользователям должны бать только grant'ованы различные права на объекты.
Нормальная практика - после импорта разработок запускать на сервере stored procedure, которая бы приводила владельцев всех объектов к единому (лучше dbo

). А после этого синхронизировать базу средствами Аксапты.