Да, тут у меня тоже подозрения были, со слоями связанные...
Старый-то функционал (утвержденный, так сказать) лежит в cus-слое. А поднимается-то все на usr!
Возможно, при этом слетают айдишники. Даже 100% так, хотя и стоит флаг "импортировать со значением идентификаторов".
Видимо, у большинства разработчиков разработка идет в одном слое, поэтому и проблема столь специфическая, мало кому известная.
Спасибо за советы огромное! Будем подумать, что можно сделать. Мораль учтем!

Спасибо огромное, г-н sukhanchik!
С Уважением,
Георгий