Синхронизация и SQL

[Михаил Андреев]

А зачем bmssa лишние права?
Нужно отобрать все серверные права типа DBO и т.п.

Хотя такую кривость я даже и не видел, но, думаю, дело именно в ней: при синхронизации часть таблиц создается заново, в двухуровневой от DBO (ибо право такое есть), а в трехуровневой - непонятно как, я экспериментировал без лишних прав, тогда получалось нормально. Кстати, у вас, похоже, еще и клиент может быть виноват (если толстый).